Верфь Lagoon была основана в 1984 году, как дочерняя компания Jeanneau Technologies Avancées (JTA) — гоночного подразделения Jeanneau. Компания JTA снискала репутацию производителя парусных яхт и многокорпусников для офшорных гонок, таких как Pierre 1er, со внушительным списком побед. Тримараны из фильма «Водный мир» с Кевином Костнером в главной роли были построены на верфи Lagoon в качестве спецпроекта.
Сегодня Lagoon является частью компании CNB, входящий в группу Beneteau Group.
Модельный ряд Lagoon проектируют всемирно известные яхтенные инженеры-архитекторы, специализирующиеся на создании гоночных яхт-многокорпусников, Marc Van Peteghem и Vincent Lauriot Prévost (VPLP).
Первое поколение катамаранов Lagoon сформировалось между 1987 и 1996 годами. Тогда появились модели Lagoon 55, 47, 57 и 67.
Начиная с 2003 года, Lagoon занимает прочные позиции в сегменте круизных катамаранов, и становится мировым лидером в их производстве.
В развитой дилерской сети Lagoon по всему миру более 80 официальных представителей бренда.
С 2010 года Nauta Design проектирует дизайн интерьеров для новых моделей Lagoon.
2013 год ознаменовал появление новых стандартов в индустрии многокорпусных яхт. Парусное вооружение и мачты новых моделей Lagoon 39 и Lagoon 52 перенесли на мидель, тем самым были значительно улучшены ходовые и скоростные характеристики Lagoon по сравнению с традиционными круизными катамаранами.
В 2014 году Lagoon начинает строить моторные яхты.
Катамараны Lagoon производят на двух заводах: модели от 38 до 45 футов строят в Бельвиль-сюр-Ви на производстве Groupe Bénéteau, катамараны больше 50 метров в длину и моторные яхты Lagoon строят на заводе CNB в Бордо.